Visi Pondok Pesantren Modern Al-Kautsar adalah semata-mata untuk beribadah kepada Allah subhanahu wata'ala dan mengharapkan ridho-Nya serta mengimplementasikan fungsi kepemimpinan di muka bumi.

Misi Umum:  Mempersiapkan individu-individu yang unggul dan berkualitas menuju terbentuknya khairul ummah (sebaik-baik ummat).

Misi Khusus:  Mempersiapkan generasi-generasi yang berilmu pengetahuan (intelektual) dan pemimpin ummat yang berkemampuan dan berkemauan untuk melaksanakan dakwah amar ma'ruf nahi munkar sesuai dengan bidang kemampuannya.